1956年8月，在中央“向科學(xué)進(jìn)軍”的號召下，交通運(yùn)輸部水運(yùn)科學(xué)研究院（以下簡稱“水運(yùn)院”）應(yīng)運(yùn)而生，從此，新中國在水運(yùn)科技領(lǐng)域有了自己的“國家隊”。
建院以來，水運(yùn)院在不同歷史時期完成了一系列國家級和省部級重大科研課題，牽頭組織開展了多項重大科研攻關(guān)，取得了一系列重要科研成果，創(chuàng)造了中國水運(yùn)科技史上的多項第一，有力地支撐了我國水運(yùn)事業(yè)的蓬勃發(fā)展。這些成果包括：與蘇聯(lián)專家合作研究和設(shè)計制造出我國第一臺浮船吸煤機(jī)；規(guī)劃了我國第一條國際集裝箱運(yùn)輸航線；研發(fā)出國內(nèi)第一只國際標(biāo)準(zhǔn)集裝箱；設(shè)計了國內(nèi)第一臺岸邊集裝箱裝卸橋；開發(fā)出第一套集裝箱碼頭管理信息系統(tǒng)，等等。
作為水運(yùn)科學(xué)研究的國家隊，在交通運(yùn)輸部黨組的正確領(lǐng)導(dǎo)下，水運(yùn)院近年來始終以加快建設(shè)交通強(qiáng)國為使命，以水運(yùn)科研高質(zhì)量發(fā)展為主題，遵循“政治建院、科研立院、改革興院、人才強(qiáng)院”的宗旨，瞄準(zhǔn)“建設(shè)交通運(yùn)輸行業(yè)高端智庫和世界一流科研機(jī)構(gòu)”的愿景目標(biāo)，深化“為政府決策提供智力支撐、為行業(yè)發(fā)展提供技術(shù)支撐”的職能定位，在為部服務(wù)、科技支撐引領(lǐng)行業(yè)發(fā)展等方面都做出了突出的貢獻(xiàn)。
水運(yùn)院深度參與我國水運(yùn)發(fā)展戰(zhàn)略政策的研究和技術(shù)支撐工作，特別是在海運(yùn)強(qiáng)國戰(zhàn)略、內(nèi)河航運(yùn)高質(zhì)量發(fā)展、智能航運(yùn)發(fā)展、世界一流港口建設(shè)、綠色航運(yùn)、港口安全應(yīng)急、交通強(qiáng)國建設(shè)試點(diǎn)任務(wù)等方面取得了多項重大研究成果。在行業(yè)技術(shù)創(chuàng)新方面發(fā)揮了示范引領(lǐng)和支撐作用，承擔(dān)了水上溢油應(yīng)急處置關(guān)鍵技術(shù)、基于船岸協(xié)同的船舶智能航行與控制關(guān)鍵技術(shù)、內(nèi)河環(huán)境污染事故應(yīng)急與生態(tài)環(huán)境風(fēng)險管控技術(shù)研究、復(fù)雜海況條件下海上目標(biāo)協(xié)同觀測及應(yīng)用技術(shù)等重大國家科研項目的研發(fā)，研制的“水運(yùn)一號”衛(wèi)星由長征11火箭搭載成功發(fā)射，成為全球首個依托商業(yè)衛(wèi)星實(shí)現(xiàn)船舶在軌智能跟蹤拍攝的衛(wèi)星載荷。
經(jīng)過多年發(fā)展，水運(yùn)院形成了“水運(yùn)經(jīng)濟(jì)、安全應(yīng)急、環(huán)保節(jié)能、現(xiàn)代物流、智能水運(yùn)、海事服務(wù)”六大專業(yè)研究體系，基本覆蓋水運(yùn)行業(yè)全領(lǐng)域；形成了集咨詢服務(wù)、裝備研發(fā)、工程設(shè)計、航運(yùn)服務(wù)、交流培訓(xùn)五大板塊于一體的業(yè)務(wù)領(lǐng)域。
水運(yùn)院建有1個國家級國際科技合作基地（水路運(yùn)輸污染防治與重特大事故應(yīng)急技術(shù)示范型基地）、1個交通運(yùn)輸行業(yè)技術(shù)研發(fā)中心（衛(wèi)生防疫技術(shù)研發(fā)中心）、4個交通運(yùn)輸行業(yè)重點(diǎn)實(shí)驗室（港口物流裝備與控制工程、集裝箱運(yùn)輸智能化、無人船舶系統(tǒng)及設(shè)備關(guān)鍵技術(shù)、綜合交通運(yùn)輸理論）。創(chuàng)立出版了《水運(yùn)科技》《水運(yùn)科學(xué)研究》等多本行業(yè)內(nèi)部刊物，定期向行業(yè)主管部門和相關(guān)機(jī)構(gòu)、企業(yè)提供《水路交通決策參考》；定期發(fā)布中國港口股票指數(shù)和中國航運(yùn)股票指數(shù)，是研判水運(yùn)行業(yè)經(jīng)濟(jì)運(yùn)行形勢的重要指標(biāo)。
水運(yùn)院總占地面積約21.8萬平方米，建筑面積約6.6萬平方米。在北京大興擁有一座占地208畝的大型綜合性實(shí)驗基地，在天津濱海新區(qū)擁有約70畝的專業(yè)實(shí)驗基地，在河南洛陽黃河小浪底庫區(qū)建有1000余畝的綠化扶貧基地。
目前，水運(yùn)院設(shè)有7個內(nèi)設(shè)機(jī)構(gòu)、12個主要科研機(jī)構(gòu)和3個保障機(jī)構(gòu)、1個博士后科研工作站，代部管理交通運(yùn)輸部環(huán)境保護(hù)中心、中國海事服務(wù)中心兩家事業(yè)單位。全國港口標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會、全國集裝箱標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會、全國起重機(jī)械標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會臂架起重機(jī)分委會、全國內(nèi)河船與水路運(yùn)輸標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會4個全國標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會及分支機(jī)構(gòu)掛靠在水運(yùn)院。受交通運(yùn)輸部委托，水運(yùn)院還負(fù)責(zé)亞太經(jīng)合組織（APEC）下設(shè)的亞太港口服務(wù)組織（APSN）秘書處、鄭和研究會秘書處、國際標(biāo)準(zhǔn)化組織船舶與海洋技術(shù)委員會港口碼頭分委會（ISO/TC8/SC27）秘書處的運(yùn)行管理工作。
水運(yùn)院現(xiàn)有在職職工1394人，其中事業(yè)編人員480人。院本部事業(yè)編職工436人，其中碩士以上學(xué)歷占84%，具有高級專業(yè)技術(shù)職稱及以上的占53%。高層次人才培育力度不斷加大，人才儲備體系初步建立。其中，全國杰出專業(yè)技術(shù)人員1人，新世紀(jì)百千萬人才工程國家級人選3人，享受國務(wù)院政府特殊津貼49人次，交通運(yùn)輸部專家委員會委員3人，交通運(yùn)輸部“新世紀(jì)十百千人才工程”第一層次人選4人，交通運(yùn)輸部科技創(chuàng)新領(lǐng)軍人才2人，交通運(yùn)輸行業(yè)重點(diǎn)領(lǐng)域創(chuàng)新團(tuán)隊2個，交通運(yùn)輸部青年科技英才15人，交通運(yùn)輸行業(yè)科技創(chuàng)新人才推進(jìn)計劃青年拔尖人才1人，中國航海學(xué)會科技貢獻(xiàn)突出人物5人，中國航海學(xué)會青年科技人才4人，中國科協(xié)青年人才托舉工程人選3人，歷年入選國家和省部級專家?guī)?00余人次。
當(dāng)前，水運(yùn)院正積極推進(jìn)交通強(qiáng)國建設(shè)試點(diǎn)任務(wù)，著力研究世界一流港口綜合評價體系、水運(yùn)安全重大風(fēng)險防控技術(shù)、港口與船舶污染防治關(guān)鍵技術(shù)、智能航運(yùn)關(guān)鍵技術(shù)、多式聯(lián)運(yùn)快速轉(zhuǎn)運(yùn)裝備關(guān)鍵技術(shù)等，在天津濱海新區(qū)建設(shè)世界規(guī)模最大、功能最強(qiáng)的海上溢油應(yīng)急處置實(shí)驗系統(tǒng)，努力在加快建設(shè)交通強(qiáng)國、當(dāng)好中國式現(xiàn)代化開路先鋒的新征程中再立新功。
